KEGG 通路与基因数据库

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KEGG 将基因、蛋白、代谢物、通路、疾病和药物等知识组织为相互关联的数据库。其通路图与功能分类常用于解释组学结果，也可以辅助研究中药成分或候选靶点所在的生物过程。

在中医药机制研究中，KEGG 的实用价值是提供统一标识和通路背景，而不是直接给出某个复方已被证明有效的结论。需要把数据库的知识结构与课题实际测得的数据、样本和实验条件结合使用。

01核心资源

PATHWAY 提供通路图，GENES 和 KO 支持基因及功能对应，化学与疾病相关模块帮助连接代谢物、药物和生物学过程。不同物种的通路及基因标识不可简单混用，分析前应确认研究对象和注释版本，必要时记录基因符号转换规则。

富集分析需明确输入基因、背景集合、统计方法和多重比较校正，不能只报告几条显著通路名称。观察通路图时还要区分上调、下调、预测关联和实验干预信息；多个通路共享基因，可能使同一生物学信号重复出现。

KEGG 网站、程序接口、批量数据与商业使用有不同规则，应依据官方许可选择访问方式。正式论文应记录访问日期、数据库版本和所用工具。通路关联或富集显著只是解释线索，仍需通过独立实验和合适研究设计支持作用机制。