Cytoscape是一个开源软件平台,用于可视化分子相互作用网络和生物通路,并将这些网络与注释、基因表达谱和其他状态数据集成。尽管最初设计用于生物研究,但现在它已经成为复杂网络分析和可视化的通用平台。Cytoscape核心发行版提供了一套基本功能,用于数据集成、分析和可视化。额外的功能可以作为应用程序(以前称为插件)使用。应用程序适用于网络和分子配置文件分析、新布局、附加文件格式支持、脚本编写以及与数据库的连接等方面。任何人都可以使用基于Java™技术的Cytoscape开放API进行开发,并鼓励应用社区的发展。大多数应用程序都可以从Cytoscape App Store免费获取。
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