知识图谱在中医药专利分析中的应用

前沿资讯2个月前发布 TCMTT
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1. 知识图谱中医药专利分析中的应用概述

1.1 知识图谱定义与中医药专利分析背景

知识图谱是一种以图的形式描述知识发展进程与内部相关关系的技术方法[1],本质上是一种大规模的语义网络,是实现知识网络可视化的有效载体[2]。在中医药领域,知识图谱的应用能够更加有效地描述、挖掘实体间的关系,使大规模知识存储更为规范、应用更加高效[3]。中医药专利分析是中医药知识图谱的一个重要应用方向,它涉及到从专利文献中提取技术信息,以客观反映产业内部的技术构成与应用现状[4]。

1.2 知识图谱在中医药专利分析中的作用

知识图谱在中医药专利分析中的作用主要体现在以下几个方面:

  • 信息整合与知识发现:知识图谱能够整合来自不同数据源的中医药专利信息,包括专利文献、科学论文等,通过可视化的方式揭示知识领域的结构和关系,促进新知识的发现[5]。
  • 专利趋势分析:基于知识图谱的专利趋势分析可以帮助研究人员和决策者了解中医药领域的技术发展动态和创新趋势。例如,通过分析专利申请量的变化,可以发现某些技术领域的热度和市场潜力[6]。
  • 技术功效与解决方案分析:知识图谱可以涵盖中医药领域专利中的解决方案、技术功效等特定实体,通过频次分析和关联规则算法(如Apriori算法)对中药处方优化进行分析,从而为中医药的创新研究提供数据支撑[7]。
  • 专利地图构建:利用知识图谱技术,可以从IncoPat专利数据库获取中医药专利数据,结合TCMSP、OMIM等数据库中的中药靶点、疾病等数据,构建专利地图,为中医药领域的多元研究提供支持[8]。
  • 促进中医药现代化:知识图谱的应用是中医药现代化、信息化的重要研究内容,有助于深入挖掘中医药知识内涵,面向中医医疗文本、中医客观诊疗数据开展技术方法研发及场景应用研究,支持智慧中医药的发展[9]。

综上所述,知识图谱在中医药专利分析中的应用,不仅能够促进中医药知识的整合与创新,还能为中医药产业的决策提供科学依据,推动中医药的现代化进程。

2. 中医药专利数据的获取与预处理

2.1 数据来源与数据类型

在中医药专利分析中,数据的获取是基础且关键的一步。根据已有研究[10],中医药专利数据主要来源于以下几个渠道:

  • 专利数据库:如IncoPat专利数据库,它提供了丰富的中医药专利数据,覆盖了全球范围内的专利信息[11]。
  • 专业信息源:包括TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)和OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)等数据库,它们提供了中药靶点、疾病等专业数据[12]。
  • 学术文献:MEDLINE、《中华医学杂志》、PubMed等,这些数据库涵盖了国内外各种医药学的数据,为中医药知识图谱的构建提供了信息基础[13]。

数据类型方面,中医药专利数据主要包括:

  • 专利文献:包括专利标题、摘要、权利要求等信息,这些是分析中医药专利技术构成和技术趋势的重要基础[14]。
  • 科学论文:提供了中医药领域的最新研究成果和理论支持,有助于理解专利背后的科学原理和技术背景[15]。
  • 临床数据:包括病历、医嘱、检验报告等,这些数据对于理解中医药专利在实际应用中的效果和价值具有重要意义[16]。

2.2 数据清洗与标准化

数据清洗和标准化是确保中医药专利数据分析结果准确性的关键步骤。以下是数据预处理的主要流程:

  • 数据清洗:包括去除重复记录、处理缺失值和纠正错误。这一步骤确保了数据的一致性和完整性,为后续分析打下坚实基础[17]。
  • 特征工程:对文本数据进行清洗、分词和向量化处理,如使用TF-IDF等方法将文本转换为机器可读的向量形式[18]。对数值型特征进行标准化或归一化处理,以消除不同量纲和数值范围带来的影响[19]。
  • 日期处理:将日期转换为距离某个参考点的天数或其他时间单位,以便于分析时间序列数据[20]。
  • 标准化:将不同医疗机构和不同国家的数据进行标准化,以确保数据的一致性和可比性。这包括统一术语、编码系统和度量单位[21]。
  • 数据整合:将不同数据源的数据进行整合,建立一个统一的数据集,以便于进行全面的分析[22]。
  • 数据验证:对整合后的数据进行验证,确保数据的准确性和完整性,这对于后续的知识图谱构建和分析至关重要[23]。

通过上述步骤,可以有效地提升中医药专利数据的质量,为构建准确的中医药知识图谱提供支持。

3. 中医药专利知识图谱构建技术

3.1 本体构建方法

本体构建是知识图谱中的关键步骤,它为中医药专利分析提供了结构化的框架[24]。本体构建方法主要包括以下几个方面:

  • 领域本体开发:基于中医药领域的专业术语和概念,开发领域本体,包括疾病、药物、治疗方式等核心类目[25]。这一步骤通常涉及专家知识和文献综述,以确保本体的准确性和全面性[26]。
  • 概念体系整合:将中医药的传统知识体系与现代专利信息进行整合,形成统一的概念体系,以便在知识图谱中进行有效的映射和关联[27]。
  • 属性和关系定义:在本体中定义中医药专利相关的属性和关系,例如药物的成分属性、治疗效果关系等,这些属性和关系有助于揭示中医药专利的深层结构和内在联系[28]。
  • 本体验证与更新:通过与领域专家的合作,对本体进行验证和更新,确保其能够适应中医药领域的快速发展和变化[29]。

3.2 实体识别与属性抽取技术

实体识别和属性抽取是构建中医药专利知识图谱的基础技术,它们从非结构化数据中提取出结构化信息[30]。

  • 命名实体识别(NER):使用自然语言处理技术,如条件随机场(CRF)和长短期记忆网络(LSTM),识别文本中的实体,如药物名称、疾病名称等[31]。
  • 属性抽取:对已识别的实体进行属性抽取,包括药物的性味归经、功效等,这些属性信息对于理解中医药专利的技术特点至关重要[32]。
  • 实体链接:将文本中的实体与知识图谱中的对应实体进行链接,以确保实体的一致性和准确性[33]。
  • 实体规范化:对识别出的实体进行规范化处理,消除同义词和不同表述之间的差异,提高实体识别的准确性[34]。

3.3 关系抽取与数据融合技术

关系抽取和数据融合技术是构建中医药专利知识图谱的核心,它们揭示了实体间的复杂关系,并整合多源数据[35]。

  • 关系抽取:通过深度学习模型,如BERT和GPT,抽取实体间的关系,如药物与疾病之间的治疗关系、药物间的配伍禁忌等[36]。
  • 数据融合:将来自不同数据源的信息进行融合,包括专利数据库、专业信息源和学术文献,以构建全面的知识图谱[37]。
  • 冲突检测与消解:在数据融合过程中,检测并解决实体和关系之间的冲突,确保知识图谱的一致性和可靠性[38]。
  • 知识图谱存储:使用图数据库如Neo4j存储知识图谱,支持高效的图查询和分析[39]。
  • 知识更新与维护:随着新数据的不断产生,定期更新和维护知识图谱,以反映最新的中医药专利信息和技术进展[40]。

4. 中医药专利知识图谱分析方法

4.1 知识图谱查询与可视化技术

在中医药专利知识图谱分析中,查询与可视化技术是理解与利用知识图谱的关键工具。这些技术能够帮助研究人员快速获取信息,深入分析数据,并直观展示分析结果。

  • 查询技术:知识图谱查询技术允许用户通过自然语言或结构化查询语言(如SPARQL)检索知识图谱中的信息。在中医药专利分析中,查询技术可以用于检索特定药物的所有专利信息,或者查找与特定疾病相关的所有治疗方法[41]。
  • 可视化技术:知识图谱的可视化技术通过图形化界面展示复杂的数据关系,使得用户能够直观地理解知识图谱的结构和内容。例如,使用D3.js或Gephi等工具,可以将中医药专利数据中的实体和关系以网络图的形式展示,帮助用户识别关键节点和路径[42]。
  • 交互式分析:交互式知识图谱工具允许用户与图形化界面进行交互,如放大、缩小、拖动和点击等操作,以探索中医药专利数据的深层信息。这种交互式分析有助于用户发现潜在的关联和模式,促进新知识的生成[43]。
  • 多维度展示:通过多维度可视化技术,可以从不同角度展示中医药专利数据,如时间序列变化、地理分布、技术领域分布等。这种多维度展示有助于全面理解中医药专利的发展趋势和技术布局[44]。

4.2 知识图谱分析工具与平台

知识图谱分析工具与平台为中医药专利分析提供了强大的技术支持。这些工具和平台不仅包括数据存储、查询和可视化功能,还包括高级分析和机器学习模块,以支持复杂的数据分析任务。

  • Neo4j:Neo4j是一个高性能的图数据库,它提供了强大的图查询语言Cypher,支持复杂的图查询和分析。在中医药专利分析中,Neo4j可以用来存储和查询大规模的专利数据,以及进行实体和关系分析[45]。
  • Apache Jena:Apache Jena是一个开源的RDF框架,它提供了RDF数据模型、存储和查询功能。Jena的SPARQL查询引擎可以用于中医药专利数据的检索和分析,支持复杂的查询和推理[46]。
  • Tableau:Tableau是一个数据可视化平台,它允许用户创建交互式和可共享的仪表板。在中医药专利分析中,Tableau可以用来展示专利数据的统计图表和地图,帮助用户快速理解数据的分布和趋势[47]。
  • Gephi:Gephi是一个开源的网络分析和可视化软件,它支持大规模图数据的可视化和探索。在中医药专利分析中,Gephi可以用来识别专利数据中的关键实体和关系,以及进行社区发现和模式识别[48]。
  • 定制化分析平台:除了通用的工具和平台,还可以开发定制化的分析平台,以满足中医药专利分析的特定需求。这些平台可以集成自然语言处理、机器学习和数据挖掘算法,以支持更高级的分析任务,如专利相似性分析、趋势预测和创新点挖掘[49]。

通过这些工具和平台的应用,中医药专利知识图谱分析可以更加高效和深入,为中医药领域的研究和决策提供强有力的支持。

5. 知识图谱在中医药专利分析的具体应用案例

5.1 专利趋势分析与知识演化

在中医药专利分析中,知识图谱技术被用于揭示专利申请的趋势和知识的演化路径。通过构建包含时间戳的专利知识图谱,可以观察到中医药领域内技术发展的历史脉络和未来趋势。

  • 专利申请趋势:利用知识图谱技术,结合IncoPat专利数据库的数据,分析了2002年至2021年间全球中药领域的专利申请情况。结果显示,全球中药专利申请量从2002年的2,582件增长到2015年的约3万件,之后呈现下降趋势,2020年降至1.1万件[50]。这一趋势反映了中医药领域技术创新的活跃周期和可能的市场调整。
  • 知识演化路径:通过知识图谱分析,可以追踪中医药专利中的关键技术术语和概念,揭示知识演化的路径。例如,从2000年至2018年,A61K(医用、牙科用或梳妆用的配制品)类别的专利数量显著增长,表明这一领域内的技术发展和创新活跃[51]。
  • 技术发展阶段:知识图谱技术还可以帮助判断中医药专利技术的发展阶段。通过时间序列分析法,结合专利技术生命周期法,可以识别出中医药领域内不同技术的发展阶段,从而为研发决策提供参考[52]。

5.2 专利技术功效与解决方案分析

知识图谱在中医药专利分析中的应用还体现在对专利技术功效和解决方案的深入分析上。这种分析有助于理解中医药专利的实际应用价值和潜在的市场机会。

  • 技术功效分析:通过知识图谱技术,可以对中医药专利中的技术功效进行频次分析,识别出最具创新性和应用前景的技术。例如,通过对中药处方优化的分析,可以发现某些中药组合物在治疗特定疾病方面具有显著效果[53]。
  • 解决方案分析:知识图谱技术可以整合多源数据,包括专利文献、科学论文和临床数据,以构建中医药专利的解决方案图谱。这种图谱可以帮助研究人员和企业发现新的治疗策略和药物组合,以及评估其有效性和安全性[54]。
  • 案例研究:以“醒脑静”和“连花清瘟”为例,知识图谱技术被用于分析这两个中药复方的专利布局。研究发现,这些复方的专利主要集中在制备方法、新剂型开发、给药系统和质量控制等方面,显示了中医药创新的多维度和技术深度[55]。

通过上述分析,知识图谱在中医药专利分析中的应用不仅增强了对专利技术的理解,还为中医药领域的创新发展提供了数据支持和决策依据。

6. 知识图谱在中医药专利分析中的挑战与展望

6.1 技术挑战与优化方向

知识图谱在中医药专利分析中的应用虽然取得了一定的进展,但仍面临着一系列技术挑战,这些挑战的解决将直接影响知识图谱的准确性和实用性。

  • 中医术语标准化问题:中医药领域术语的多样性和复杂性给知识图谱的构建带来了难题。为了提高实体识别的准确性,需要建立统一的中医术语标准[56]。未来的研究可以集中在构建和维护一个全面、权威的中医术语词典,以支持知识图谱的构建和更新。
  • 知识图谱模式层构建问题:中医药领域的隐性知识丰富,关系复杂,导致知识图谱的模式层构建耗时且复杂。研究者需要探索更高效的本体构建方法,以适应快速变化的中医药领域知识[57]。此外,模式层的构建也需要考虑多源数据的融合,以及如何更好地表达实体间的时空特性和多元关系。
  • 知识融合技术规范问题:随着中医药数据的不断增长,如何有效地融合不同来源的知识成为一个挑战。研究者需要开发和完善知识融合技术,包括实体对齐、冲突检测与消解等,以实现异构知识图谱之间的互操作[58]。
  • 推理方法设计与选择问题:中医药知识图谱辅助诊疗系统的构建需要依赖于有效的推理方法。研究者需要设计和选择适合中医药领域的推理方法,以提高知识图谱的决策支持能力[59]。未来的研究可以探索结合传统逻辑推理和机器学习技术的混合推理方法,以提高推理的准确性和适应性。

6.2 知识图谱未来发展对中医药专利分析的影响

知识图谱技术的未来发展将对中医药专利分析产生深远影响,这些影响体现在以下几个方面:

  • 提高分析效率和准确性:随着知识图谱构建技术的不断进步,中医药专利分析的效率和准确性将得到显著提高。例如,通过深度学习技术的应用,可以更准确地识别和链接专利文献中的实体和关系[60]。
  • 促进中医药知识的创新应用:知识图谱技术的发展将促进中医药知识的创新应用,如智能问答、个性化治疗方案推荐等。这些应用将为中医药领域带来新的研究和商业机会[61]。
  • 加强中医药领域的国际合作:知识图谱技术的发展将有助于加强中医药领域的国际合作。通过构建多语言和跨文化的中医药知识图谱,可以促进中医药知识的全球传播和应用[62]。
  • 推动中医药现代化进程:知识图谱技术的应用是中医药现代化、信息化的重要研究内容。随着知识图谱技术的发展,中医药知识的挖掘和应用将更加深入,为中医药的现代化进程提供强有力的技术支持[63]。

综上所述,知识图谱技术在中医药专利分析中的应用前景广阔,但也面临诸多挑战。未来的研究需要集中在技术创新和优化上,以充分发挥知识图谱在中医药领域的潜力。

7. 总结

本章节对知识图谱在中医药专利分析中的应用进行了全面的研究和分析。通过梳理知识图谱的定义、构建方法、分析工具以及在中医药专利分析中的具体应用案例,我们可以看到知识图谱技术为中医药领域带来的深远影响和巨大潜力。

7.1 知识图谱的中医药专利分析价值

知识图谱作为一种新兴的技术方法,已经在中医药专利分析中展现出显著的价值。它不仅能够整合和挖掘中医药专利中的实体关系,促进新知识的发现,还能通过专利趋势分析揭示技术发展动态,为决策提供科学依据。此外,知识图谱在技术功效与解决方案分析中的应用,为中医药的创新研究提供了数据支撑,推动了中医药的现代化进程。

7.2 技术挑战与未来方向

尽管知识图谱在中医药专利分析中取得了一定的进展,但仍面临诸多技术挑战,如中医术语的标准化、知识图谱模式层的构建、知识融合技术规范以及推理方法的设计与选择等问题。未来的研究需要集中在这些技术创新和优化上,以提高知识图谱的准确性和实用性,充分发挥其在中医药领域的潜力。

7.3 发展趋势与影响

知识图谱技术的未来发展将对中医药专利分析产生深远影响。它将提高分析效率和准确性,促进中医药知识的创新应用,加强国际合作,并推动中医药现代化进程。随着技术的不断进步,知识图谱有望成为中医药领域不可或缺的工具,为中医药的传承和发展提供强有力的技术支持。

综上所述,知识图谱在中医药专利分析中的应用前景广阔,它不仅能够促进中医药知识的整合与创新,还能为中医药产业的决策提供科学依据,推动中医药的现代化进程。未来的研究和实践需要不断探索和优化知识图谱技术,以实现其在中医药领域的更大价值。

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